①、因属于同种元素的原子和离子，则质子数相同，故①错误；
②、因原子失去电子变为阳离子，Fe2+、Fe3+的电荷不同，则它们由原子变为离子时失去的电子不同，即它们的核外排布不同，故②正确；
③它们的最外层电子数不同，Fe的核外电子数等于核内质子数，Fe2+的核外电子数比核内质子数少2个，Fe3+的核外电子数比核内质子数少3个，故它们的最外层电子数不同，故③正确；
④、电子的质量很小，可忽略，则原子和离子的相对原子质量相同，说法正确，故④正确；
⑤、因Fe、Fe2+、Fe3+三种粒子的核外电子数不同，最外层电子数也不同，所以化学性质不同，说法错误；
⑥、它们都属于同种元素，故⑥正确．
故②③④⑥正确．
故选C
