B
分析:根据决定元素种类的微粒考虑.
解答:A、同种元素的原子核离子的电子数不同,但属于同种元素,所以两种元素的本质区别不是核外电子数,故A错;
B、决定元素种类的是原子的核电荷数或核内质子数,碳元素质子数是6,氧元素质子数是8,本质区别在于质子数不同,故B正确;
C、最外层电子数决定于元素的化学性质,不能决定元素的种类,故C错;
D、碳元素与氧元素的本质区别在于元素原子中质子数不同,因为有的原子的原子核中没有中子,所以两种元素的区别不是中子数不同,故D错;
故选B.
点评:解答本题关键是要知道决定元素种类的是原子的核电荷数或核内质子数.