分析：A、二氧化碳的密度比空气大，不能供给呼吸，不能燃烧，不支持燃烧；可燃性气体与氧气混合达到一定程度时，遇明火会发生爆炸；煤不完全燃烧时能生成一氧化碳．
B、水中磷元素含量过高时，会污染水体；乙醇燃烧生成水和二氧化碳，是一种比较清洁的能源；化石燃料的燃烧能够导致酸雨．
C、分子、原子核离子是构成物质的三种基本微粒．
D、物质是由元素组成的，地壳中含有多种元素，由高到低的顺序是氧元素、硅元素、铝元素、铁元素、钙元素等．
解答：解：A、二氧化碳的密度比空气大，容易聚集在低洼地带，因此进入深井前，应该先做灯火实验，以确保安全，正确；如果可燃性气体不纯，点燃或加热时可能会发生爆炸，所以点燃可燃性气体之前，应该验纯，正确；如果氧气不足，煤燃烧时能够产生一氧化碳，一氧化碳能使人中毒，所以使用燃煤炉子取暖时，要注意室内通风，正确．
B、使用无磷洗衣粉能够减少水污染，正确；使用乙醇汽油能够减少二氧化硫、氮氧化物的排放，正确；用新型能源代替化石燃料，可以减少二氧化硫、氮氧化物的排放，从而减少酸雨的发生，正确．
C、铜是由原子构成的物质，正确；氧气是由分子构成的物质，正确；氯化钠是由离子构成的物质，正确．
D、水是由氢元素和氧元素组成的，正确；地壳中含量最多的元素是氧元素，不是铝元素，不正确；空气中含量最多的元素是氮元素，正确．
故选：D．
点评：化石燃料的使用，带来了严重的环境污染，开发利用新能源既有利于节约化石燃料，也有利于保护环境．
