分析：根据具有相同质子数的粒子，粒子可能为分子、原子、离子，据此进行分析判断即可．
解答：解：A、水分子、氨分子、氖原子等具有相同的质子数是10，但不属于同种元素，故选项说法错误．
B、水分子、氨分子等具有相同的质子数是10，但它们不是同一种原子，故选项说法错误．
C、钠离子和铵根离子的质子数都是11，则可能是两种离子；所以B说法错误；再如水分子和氖原子具有相同的质子数（均是10），则可能是一种分子和一种原子；故选项说法错误．
D、综上所述，具有相同质子数的粒子，可能为分子、原子、离子，不能确定，故选项说法正确．
故选D．
点评：本题考查具有相同质子数的微粒，学生应明确常见的粒子有分子、原子、离子，利用举例的方法来判断说法的正误是正确解答本题的捷径．
