分析:根据纯净物是一种物质,从微观上分析只有一种分子构成,而混合物中至少含有两种物质来解答.
解答:解:A、自然界的水中含有水、二氧化碳等物质,则属于混合物,故A错误;
B、试剂瓶中的金属铜、锌、钙都是只有一种元素组成的物质,属于单质,也属于纯净物,故B正确;
C、过滤后的水只能除去不溶性的杂质,水中可能还含有可溶性矿物质,则属于混合物,故C错误;
D、可口可乐饮料中含有咖啡因、碳酸、糖、磷酸色素等物质,则属于混合物,故D错误;
故选B.
点评:本题考查物质类别的判断,学生应了解生活中常见的物质的成分是解答的关键,并能结合纯净物的概念从宏观和微观两个不同角度来分析.