分析：结合对成对基因控制作用的理解逐一对选项中的描述进行分析，最后做出判断．
解答：解：A、显性基因控制显性性状，隐性基因控制隐性性状，符合基因的控制特点，说法正确；
B、等位基因又称对偶基因，在等位基因中，只表现显性基因的性状，因此显性基因对隐性基因有掩盖作用，说法正确；
C、只有显性基因控制的性状才能表现出来，所以成对基因Aa存在时只表现显性性状，说法正确；
D、基因组成不同，所表现的性状有可能相同，也有可能不同，说法错误．
故选D．
点评：本题考查了基因的显性、隐性及其与性状表现之间的关系，尤其要注意基因组成不同，所表现的性状有可能相同，也有可能不同．
