分析：等位基因（英语：allele），又称对偶基因，是一些占据染色体的基因座的可以复制的脱氧核糖核酸．大部分时候是脱氧核糖核酸列，有的时候也被用来形容非基因序列．
解答：解：等位基因（allele又作allelomorph）一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因．若成对的等位基因中两个成员完全相同，则该个体对此性状来说成为纯合子．若两个等位基因各不相同，则该个体对该性状来说是杂合子．EE、ee是成对的等位基因中两个成员完全相同的纯合体；Ee是成对的等位基因中两个成员完全相反的杂合体；Ef在同一对染色体上的位置不同，不是等位基因．因此属于等位基因的是EE、ee、Ee．
故选A、B、C．
点评：解答此类题目的关键是知道等位基因位于同一对染色体而且位置相同．
