分析：此题考查的是生物圈的内容，据此答题．
解答：解：A、空气、水和土壤是生物生存的三要素，干净的空气、清洁的淡水和肥沃而没有受到污染的土壤，能使万物欣欣向荣地生长和繁衍．不符合题意．
B、日光不易穿透深层海洋，不适合生物的生存，因此深海中生物较少，但也有生物存在，如珊瑚虫、海星和部分微生物等．不符合题意．
C、生物圈包括大气圈的底部、岩石圈的表面和水圈的大部，生物主要生活在这个范围之内，但大气圈的上部、岩石圈的内部以及水圈的底层也有少量生物的存在．不符合题意．
D、生物圈包括大气圈的底部、岩石圈的表面和水圈的大部，人类可以借助工具到达生物圈的各个圈层．符合题意．
故选：D
点评：生物圈的知识是中考的热点，要重点掌握，并能灵活答题．
