A
分析：此题考查的是人的性别遗传，基因的显性与隐性，等位基因，遗传的变异，据此分析解答．
解答：A、人体细胞内与性别决定有关的染色体叫做性染色体，男性的性染色体是XY，女性的性染色体是XX．当含Y染色体的精子与含X染色体的卵细胞结合形成受精卵时，受精卵将发育成男婴，当含X染色体的精子与含X染色体的卵细胞结合形成受精卵时，受精卵将发育成女孩．由此可见，生男生女决定于生殖过程中卵细胞与哪一种类型的精子相融合．男性产生的两种类型的精子与卵细胞结合的机会是均等的，因此生男生女的几率是一样的，如果小明的父母再生第二胎，是男孩是女孩的几率都是50%，因此不一定是妹妹．故符合题意；
B、表现型是指具有特定基因型的个体，在一定环境条件下，所表现出来的性状特征的总和．基因型相同的个体，在不同的环境条件下，可以显示出不同的表现型．基因型不同的个体，也可以呈现出同样的表现型．例如，杂合子的高茎豌豆基因型为Dd，纯合子的高茎豌豆基因型为DD，但二者均显示出高茎的表现型．因此表现型是基因型与环境共同作用的结果．故不符合题意；
C、位于同一对染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因就是等位基因．故不符合题意；
D、变异是指亲代间和子代个体间的差异，根据变异是否可以遗传，分为可遗传变异和不可遗传变异，遗传物质改变引起的变异属于可遗传的变异，仅由环境因素引起的变异属于不可遗传的变异．故不符合题意．
故选A
点评：解答此类题目的关键是灵活运用所学知识解释实际问题．
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