分析：此题属于生物分类的判断，判断一种生物是否属于原核生物，首先你要清楚地知道原核生物和真核生物的差别．
解答：解：原核生物是一种无细胞核的单细胞生物，它们的细胞内没有任何带膜的细胞器．原核生物包括细菌和以前称作“蓝绿藻”的蓝细菌，是现存生物中最简单的一群，以分裂生殖繁殖后代．原核生物曾是地球上唯一的生命形式，它们独占地球长达20亿年以上．原核生物一般比较低等，有细菌，蓝藻，立克次氏体，衣原体，支原体放线菌等．微囊藻是一种出现在淡水中的蓝菌，会产生有害藻华，具有一定的生态学与经济重要性．
而真核生物相对高等，植物，动物和真菌都属于真核生物．该题中衣藻和硅藻、甲藻均属于绿色植物，因此微囊藻是原核生物．
故选：D
点评：判断一种生物是否属于原核生物，最主要的区别是真核生物有成形的细胞核，即原核生物没有成形的细胞核．
