分析：在一定区域内生物和它所生活的环境就形成一个生态系统．它包括生物部分和非生物部分．生物部分包括植物、动物、细菌真菌等微生物，非生物部分包括阳光、空气、水、土壤、温度等．
解答：解：A、黄河中的鲤鱼，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．
B、洞庭湖中的生物，只包括了生物部分，没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．
C、草原上的羊，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．
D、朱鹮自然保护区，即包括了保护区所在的环境，又包括了此环境中所有的生物，是一个完整的生态系统，符合题意．
故选：D
点评：只要熟练掌握了生态系统的概念，仔细分析选项中的内容是否符合生态系统的概念，即可正确答题．
