D
分析:判断命题是否为假命题,就要判断由题设能否推出结论,能推出,则该命题为真命题;不能推出,则该命题为假命题.
解答:A、等腰三角形两底角相等,是等腰三角形的性质,是真命题,故本选项错误;
B、内错角相等,两直线平行,是平行线的判定,是真题,故本选项错误;
C、矩形的对角线相等,是矩形的性质,是真命题,故本选项错误;
D、相等的角未必是对顶角,如等腰三角形的两底角相等,但不是对顶角,故本选项正确.
故选D.
点评:本题考查了命题与定理,不仅要熟悉命题的概念,还要熟悉三角形、矩形、对顶角等相关知识.