D
分析:A、原子由原子核与核外电子组成;
B、原子由原子核与核外电子组成,原子核由质子与中子组成;
C、水凝固变成冰时,分子间距离变大,冰的体积大于同一水的体积;
D、组成物质的分子不停地做无规则运动,物体温度越高,分子热运动越剧烈.
解答:A、原子模型和太阳系相似,原子由原子核与核外电子组成,故A错误;
B、原子、原子核、质子是按物质结构顺序排列的,故B错误;
C、水结冰体积变大,是因为分子间距离变大造成的,故C错误;
D、温度越高,分子的热运动越剧烈,故D正确;
故选D.
点评:本题考查了物质组成的知识,是一道基础题,掌握基础知识即可正确解题.